ระบบน้ำบริสุทธิ์ส่วนใหญ่แบ่งออกเป็นระบบรีเวอร์สออสโมซิส ระบบแลกเปลี่ยนไอออน ระบบอิเล็กโทรไลเซชัน (EDI) และระบบอัลตราฟิลเตรชัน ระบบต่างๆ เหมาะสำหรับการใช้งานในห้องปฏิบัติการ อุตสาหกรรม หรือในครัวเรือน ขึ้นอยู่กับกระบวนการและคุณภาพของน้ำทิ้ง
ประเภททั่วไปตามการใช้งานและเทคโนโลยีการทำให้บริสุทธิ์มีดังนี้:
ระบบรีเวอร์สออสโมซิส (RO): กำจัดไอออน สารอินทรีย์ แบคทีเรีย และอนุภาคได้มากกว่า 95% ผ่านการกรองแบบเมมเบรนกึ่ง-ที่ซึมเข้าไปได้ ทำให้เกิดน้ำบริสุทธิ์เกรด III (น้ำ RO) ใช้กันอย่างแพร่หลายสำหรับการทำความสะอาดห้องปฏิบัติการขั้นพื้นฐาน การล้างเครื่องแก้ว และเป็นขั้นตอนการปรับสภาพล่วงหน้าสำหรับน้ำที่มีความบริสุทธิ์สูง-
ระบบแลกเปลี่ยนไอออน: ใช้ไอออนเชิงฟังก์ชันบนเรซินเพื่อแลกเปลี่ยนกับไอออน เช่น แคลเซียม แมกนีเซียม และโซเดียมในน้ำ ช่วยขจัดไอออนความกระด้างและเกลือที่ละลายได้อย่างมีประสิทธิภาพ มักใช้ในขั้นตอนการบำบัดแบบละเอียดเพื่อปรับปรุงความบริสุทธิ์ของน้ำ
ระบบอิเล็กโทรดีไอออนไนเซชัน (EDI): ผสมผสานเทคโนโลยีอิเล็กโตรไดอะลิซิสและการแลกเปลี่ยนไอออน เพื่อขจัดไอออนออกจากน้ำอย่างต่อเนื่องภายใต้สนามไฟฟ้ากระแสตรง ไม่จำเป็นต้องมีการฟื้นฟูทางเคมี สามารถผลิตน้ำบริสุทธิ์เกรด II หรือแม้แต่น้ำบริสุทธิ์พิเศษเกรด I ได้อย่างเสถียร เหมาะสำหรับอุตสาหกรรมที่มีมาตรฐานสูง- เช่น อิเล็กทรอนิกส์และเภสัชกรรม
ระบบการกรองแบบอัลตราฟิลเตรชันใช้เมมเบรนแบบอัลตราฟิลเตรชันเพื่อกำจัดโมเลกุลอินทรีย์ขนาดใหญ่ ไพโรเจน และจุลินทรีย์ ในขณะที่ยังคงรักษาแร่ธาตุบางชนิดไว้ โดยทั่วไปจะใช้ในการทดลองวิทยาศาสตร์ชีวภาพสำหรับการใช้งานที่ไวต่อ RNase/DNase

